ISO14001认证运行控制是对组织的环境管理体系实施控制的过程，本要素控制的不是重要环境因素本身，而是与其相关的运行情况。
1、制定运行控制程序的主要目的：实现组织的环境方针和目标指标。
2、运行控制的对象：与评价出的重要环境因素有关的运行。
3、过程：对有关的运行活动(包括维护活动)进行策划，并编制相应的文件化程序，确保它们在程序的控制下实施。判断是否需要程序文件的准则是:对于与重要环境因素有关的运行，如果没有成文的程序就有可能导致偏离组织的环境方针，影响ISO14001认证环境目标的实现的就要制定程序。如:化学危险品管理程序、污水处理站运行控制程序等。
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